More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1759 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  100 
 
 
476 aa  952  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
476 aa  952  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.65 
 
 
465 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
480 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
464 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
472 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
480 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
469 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
469 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
469 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
471 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
471 aa  263  5e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
466 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  36.84 
 
 
463 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
458 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  36.61 
 
 
463 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
481 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  37.34 
 
 
467 aa  254  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
469 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.11 
 
 
466 aa  253  4e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
486 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  34.29 
 
 
462 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
465 aa  245  1e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
474 aa  245  1e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.89 
 
 
486 aa  244  2e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
477 aa  244  2e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  34.72 
 
 
462 aa  245  2e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
463 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
471 aa  240  3e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
487 aa  239  6e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
462 aa  238  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.06 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
493 aa  236  5e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
462 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.05 
 
 
469 aa  236  1e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
493 aa  236  1e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.55 
 
 
468 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.06 
 
 
464 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  34.85 
 
 
464 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  34.85 
 
 
464 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  34.85 
 
 
464 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  34.85 
 
 
464 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  34.85 
 
 
464 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  34.85 
 
 
715 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
489 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
481 aa  226  5e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  35.01 
 
 
473 aa  221  2e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
465 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
465 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.53 
 
 
475 aa  220  4e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  32.53 
 
 
472 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
472 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
472 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
472 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.6 
 
 
463 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
477 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
486 aa  219  8e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  34.37 
 
 
481 aa  219  9e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
477 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  32.97 
 
 
463 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.73 
 
 
466 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
486 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  32.31 
 
 
463 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  34.14 
 
 
460 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
486 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
460 aa  217  3e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
465 aa  218  3e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
460 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.73 
 
 
461 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.89 
 
 
471 aa  216  6e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  35.15 
 
 
455 aa  215  1e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.84 
 
 
483 aa  216  1e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
461 aa  215  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
462 aa  214  3e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.64 
 
 
462 aa  214  3e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  30.87 
 
 
468 aa  213  4e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  32.4 
 
 
463 aa  213  6e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
474 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
474 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
474 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  32.73 
 
 
471 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
474 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  34.06 
 
 
484 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.28 
 
 
484 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
468 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  42.16 
 
 
436 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
467 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  9.553e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  34.23 
 
 
431 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  32.74 
 
 
472 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
456 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
475 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
467 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
469 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
468 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
468 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
468 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
468 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
458 aa  203  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
445 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>