243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0045 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 266 aa  546  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  96.02 
 
 		 251 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  75.3 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  57.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  56.47 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  52.4 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  37.14 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  37.27 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  37.27 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  36.77 
 
 		 224 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  37 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  37 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  33.94 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  33.06 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  33.03 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  30.95 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  33.96 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  29.91 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.26 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.37 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.28 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.26 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  25.73 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.08 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.39 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.83 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.33 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  31.17 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  26.96 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  27.59 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  29.13 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.4 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  33.93 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.6 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.58 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.07 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.6 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.83 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  26.45 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  31.11 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.38 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.6 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.13 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.23 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  26.35 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.37 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.14 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  26.35 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  26.35 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.29 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  26.35 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  36.99 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  36.05 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  26.29 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.54 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.22 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.39 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.54 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  27.7 
 
 		 344 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.54 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  28.4 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  28.07 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  25.15 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>