More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5355 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  65.55 
 
 		 1047 aa  1423    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.65 
 
 		 1047 aa  1424    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0622  cation efflux system protein cusA  65.65 
 
 		 1047 aa  1424    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00104736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  49.24 
 
 		 1045 aa  1019    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1507    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  59.64 
 
 		 1049 aa  1313    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  61.1 
 
 		 1048 aa  1312    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.28 
 
 		 1052 aa  1527    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  60.77 
 
 		 1042 aa  1326    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  75.43 
 
 		 1039 aa  1583    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1505    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.86 
 
 		 1066 aa  1165    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  58.4 
 
 		 1039 aa  1243    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  91.9 
 
 		 1047 aa  1935    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  65.68 
 
 		 1048 aa  1434    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  55.68 
 
 		 1043 aa  1158    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  60.47 
 
 		 1052 aa  1291    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  46.61 
 
 		 1100 aa  942    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  59.64 
 
 		 1045 aa  1300    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  59.55 
 
 		 1045 aa  1286    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  68.94 
 
 		 1038 aa  1504    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1507    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  73.12 
 
 		 1052 aa  1558    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  49.18 
 
 		 1047 aa  1043    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  34.98 
 
 		 1049 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  59.73 
 
 		 1049 aa  1316    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  57.58 
 
 		 1056 aa  1164    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  54.35 
 
 		 1061 aa  1110    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  60.13 
 
 		 1045 aa  1313    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1054 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  56.11 
 
 		 1051 aa  1176    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  56.45 
 
 		 1044 aa  1160    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  47.05 
 
 		 1091 aa  975    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  47.56 
 
 		 1045 aa  999    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4591  CzcA family heavy metal efflux protein  56.75 
 
 		 1055 aa  1147    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  73.74 
 
 		 1050 aa  1576    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  71.4 
 
 		 1060 aa  1545    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  71.55 
 
 		 1068 aa  1528    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  56.62 
 
 		 1058 aa  1135    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  71.26 
 
 		 1070 aa  1501    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  59.71 
 
 		 1049 aa  1315    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  47.13 
 
 		 1046 aa  964    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  61.8 
 
 		 1040 aa  1309    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  56.1 
 
 		 1047 aa  1245    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.79 
 
 		 1067 aa  1192    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.62 
 
 		 1074 aa  1039    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  74.21 
 
 		 1056 aa  1580    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06366  hypothetical protein  60.69 
 
 		 1059 aa  1300    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.78 
 
 		 1074 aa  1181    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 		 1070 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  47.99 
 
 		 1045 aa  1013    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0593  cation efflux system protein cusA  65.46 
 
 		 1047 aa  1424    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550143  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  65.49 
 
 		 1048 aa  1431    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1505    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  59.63 
 
 		 1054 aa  1238    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3972  CzcA family heavy metal efflux protein  56.81 
 
 		 1057 aa  1157    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  62.07 
 
 		 1056 aa  1325    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  43.66 
 
 		 1015 aa  878    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4264  CzcA family heavy metal efflux protein  46.37 
 
 		 1092 aa  961    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0061881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  52.11 
 
 		 1059 aa  1104    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  71.5 
 
 		 1068 aa  1533    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  59.75 
 
 		 1049 aa  1318    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3362  CzcA family heavy metal efflux protein  68.71 
 
 		 1039 aa  1415    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  47.49 
 
 		 1094 aa  979    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  55.95 
 
 		 1051 aa  1142    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  73.33 
 
 		 1049 aa  1568    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  55.03 
 
 		 1043 aa  1169    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  61.52 
 
 		 1039 aa  1323    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  59.71 
 
 		 1047 aa  1306    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  60 
 
 		 1045 aa  1307    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  60.29 
 
 		 1042 aa  1252    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  56.72 
 
 		 1052 aa  1160    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  55.96 
 
 		 1069 aa  1171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.67 
 
 		 1040 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  77.78 
 
 		 1063 aa  1667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  77.86 
 
 		 1056 aa  1659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.24 
 
 		 1048 aa  1016    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.57 
 
 		 1049 aa  909    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  57.38 
 
 		 1042 aa  1246    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  56.32 
 
 		 1063 aa  1157    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  56.53 
 
 		 1043 aa  1141    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1507    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  77.11 
 
 		 1055 aa  1644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  55.04 
 
 		 1060 aa  1144    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.32 
 
 		 1065 aa  1151    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  56.42 
 
 		 1057 aa  1172    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  55.62 
 
 		 1059 aa  1169    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  55.92 
 
 		 1060 aa  1149    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  70.98 
 
 		 1070 aa  1507    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  88.33 
 
 		 1056 aa  1887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0355  CzcA family heavy metal efflux protein  53.36 
 
 		 1044 aa  1052    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  88.25 
 
 		 1055 aa  1901    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  67.88 
 
 		 1044 aa  1439    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  69.04 
 
 		 1044 aa  1462    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  72.48 
 
 		 1047 aa  1555    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0210  CzcA family heavy metal efflux protein  59.43 
 
 		 1045 aa  1303    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  71.55 
 
 		 1068 aa  1528    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  60.44 
 
 		 1045 aa  1278    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  56.33 
 
 		 1058 aa  1154    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  59.9 
 
 		 1045 aa  1313    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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