233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1847 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  91.01 
 
 		 358 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  83.57 
 
 		 358 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  99.45 
 
 		 362 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  84.23 
 
 		 358 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 362 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  77.4 
 
 		 368 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  77.68 
 
 		 368 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  75.56 
 
 		 368 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  72.78 
 
 		 368 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  71.11 
 
 		 368 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  72.35 
 
 		 361 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  71.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  72.35 
 
 		 361 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  72.14 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  71.31 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  67.41 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  68.21 
 
 		 368 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  69.64 
 
 		 363 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  67.5 
 
 		 363 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  67.31 
 
 		 362 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  66.02 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  58.43 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  58.58 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  57.99 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  58.97 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  55.37 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  56.13 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  55.84 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  53.31 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  53.59 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  54.42 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  55.66 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  54.7 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  56.53 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  53.61 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  52.97 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  55.1 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  51.43 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  51.45 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.05 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  51.2 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  48.52 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  51.35 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 		 353 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  48.81 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  50.99 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  48.79 
 
 		 342 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.99 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  45.57 
 
 		 336 aa  291  8e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.79 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  38.24 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  39.18 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  36.51 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.98 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  43.13 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.94 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.18 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.5 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 355 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.63 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.51 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.03 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  36.78 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 355 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  34.71 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  34.71 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.53 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.72 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>