138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3770 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 497 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  44.58 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  46.58 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  35.25 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  30.82 
 
 		 500 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 507 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.34 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.4 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.63 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.4 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.32 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.32 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 488 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.32 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.32 
 
 		 510 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  25.53 
 
 		 475 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.32 
 
 		 503 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  25.53 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.42 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  29.06 
 
 		 504 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.35 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  28.31 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.35 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  19.42 
 
 		 476 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.35 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.35 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.35 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  28.45 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.07 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  22.81 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.68 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.07 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24.92 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  23.23 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  21.78 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.36 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.81 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.03 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.74 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.08 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  19.94 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  19.27 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>