More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1084 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  94.24 
 
 		 382 aa  713    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 382 aa  774    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  51.43 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  56.81 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  53.02 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  51.18 
 
 		 381 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  50.53 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  44.65 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  44.36 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  46.76 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  44.62 
 
 		 384 aa  338  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  41.1 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  44.22 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  43.65 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  40.91 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  43.35 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  39.21 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  36.04 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.53 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.08 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.98 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  32.84 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  34.41 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.25 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  35.04 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  31.84 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  32.83 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  35.45 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  32.92 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.51 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  34.19 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  30.23 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.68 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 395 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 390 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.6 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  31.46 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.33 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  31.2 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  31.88 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.58 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  35.86 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.85 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.85 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  30.02 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  32.02 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>