More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0623 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  55.38 
 
 		 651 aa  714    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  89.49 
 
 		 649 aa  1207    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  62.76 
 
 		 633 aa  837    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  86.4 
 
 		 649 aa  1139    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  54.7 
 
 		 646 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 		 631 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 647 aa  1319    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  47.61 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  46.93 
 
 		 661 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 		 655 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  46.5 
 
 		 643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  46.84 
 
 		 652 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  46.66 
 
 		 642 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  46.54 
 
 		 654 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  45.47 
 
 		 642 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  46.68 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 657 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  45.7 
 
 		 642 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  43.29 
 
 		 630 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  45.68 
 
 		 643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  45.4 
 
 		 643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.63 
 
 		 650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  43.13 
 
 		 630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 644 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 645 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 650 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 682 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 630 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 		 654 aa  568  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 648 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 		 653 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 655 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 		 658 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  44.16 
 
 		 654 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  41.97 
 
 		 656 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 		 648 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 653 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  42.18 
 
 		 653 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 648 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  41.81 
 
 		 656 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 661 aa  538  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 		 648 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 657 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 		 659 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 		 636 aa  485  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 607 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  43.3 
 
 		 634 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 		 623 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  39.9 
 
 		 603 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 618 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 611 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 601 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 649 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 633 aa  349  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 605 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 606 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 606 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 606 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 604 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 617 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 604 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 596 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 610 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 603 aa  327  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 592 aa  327  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  31.7 
 
 		 602 aa  326  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 603 aa  318  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 602 aa  316  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.2 
 
 		 610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 635 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.79 
 
 		 587 aa  309  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 633 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 590 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.99 
 
 		 601 aa  300  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  32.47 
 
 		 600 aa  297  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.9 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 612 aa  293  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>