More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1334 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  83.33 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  72.79 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  45.52 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.26 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.99 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.67 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.67 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  40.82 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.78 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  40.25 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.42 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.62 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  40.41 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.13 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  38.16 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.48 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.25 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  38.26 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.16 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  37.75 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.79 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  38.36 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  33.96 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 325 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.41 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  39.19 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  38.36 
 
 		 291 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.67 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  37.18 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  38.82 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  35.81 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  37.97 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.77 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  40.41 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.41 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36.71 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  36.31 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.42 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.94 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.41 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>