More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0416 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  80.17 
 
 		 464 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  100 
 
 		 464 aa  955    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  62.12 
 
 		 491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.5 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  40.6 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.82 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  38.02 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  38.02 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.58 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40.05 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  40.9 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40.05 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  38.36 
 
 		 460 aa  273  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  39.76 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  39.62 
 
 		 453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.25 
 
 		 438 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.4 
 
 		 517 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  39.84 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  37.44 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.97 
 
 		 490 aa  240  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.01 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.75 
 
 		 473 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.75 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.48 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.03 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.62 
 
 		 474 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.03 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.18 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.32 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.79 
 
 		 503 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.96 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.41 
 
 		 470 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.57 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.72 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  35.93 
 
 		 480 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  35.37 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.65 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  32.78 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.39 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.31 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  32.87 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.12 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.89 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.46 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.12 
 
 		 741 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.26 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.06 
 
 		 475 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.6 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.35 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  32.1 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.96 
 
 		 468 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.96 
 
 		 468 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.47 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.1 
 
 		 468 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.07 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  33.69 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.35 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.13 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  33.61 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  40.15 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  30.87 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  33.15 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.34 
 
 		 503 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.42 
 
 		 569 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  30.94 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  30.35 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.16 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 		 439 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  30.61 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.41 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  34 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  31.57 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.24 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.08 
 
 		 533 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  43.78 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 472 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  42.36 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  40.38 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.98 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  39.19 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  40.38 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.93 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  40 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  32.29 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  36.13 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  32.13 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.5 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.46 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.55 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.49 
 
 		 421 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  39.08 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.49 
 
 		 421 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.68 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  28.24 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  39.6 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.07 
 
 		 385 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.33 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  39.6 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>