More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0015 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0015  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0039  ATP-dependent RNA helicase DbpA  57.56 
 
 		 474 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5284  ATP-dependent RNA helicase DbpA  56.19 
 
 		 467 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3249  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5098  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0214  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.29 
 
 		 465 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5240  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.11 
 
 		 464 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4313  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.81 
 
 		 465 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  hitchhiker  0.00000166759 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2223  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 463 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 463 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0202  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.718182  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0961  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1659  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4994  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.81 
 
 		 465 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.317597  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1944  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.55 
 
 		 465 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.423586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0030  ATP-dependent RNA helicase DbpA  52.11 
 
 		 467 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0291  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.07 
 
 		 465 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  52.86 
 
 		 465 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0013  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.4 
 
 		 463 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.37 
 
 		 477 aa  215  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4436  ATP-dependent RNA helicase DbpA  51.64 
 
 		 467 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0622  ATP-dependent RNA helicase DbpA  54.15 
 
 		 465 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.07 
 
 		 487 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  51.17 
 
 		 473 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2997  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.37 
 
 		 477 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2177  ATP-independent RNA helicase  53.66 
 
 		 473 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5212  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.28 
 
 		 476 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1129  ATP-dependent RNA helicase DbpA  47.2 
 
 		 466 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.965871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0479  ATP-dependent RNA helicase DbpA  48.33 
 
 		 458 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4421  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.33 
 
 		 465 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4311  ATP-dependent RNA helicase DbpA  53.33 
 
 		 465 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0489  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.39 
 
 		 469 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3705  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.39 
 
 		 469 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0825839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3542  ATP-dependent RNA helicase DbpA  50.97 
 
 		 467 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  48.97 
 
 		 468 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05950  ATP-dependent RNA helicase DbpA  47.37 
 
 		 458 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.214385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0558  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.89 
 
 		 458 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0513  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.44 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227206  normal  0.370173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0598  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.91 
 
 		 468 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3275  ATP-dependent RNA helicase DbpA  50.27 
 
 		 479 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3384  ATP-dependent RNA helicase DbpA  50.27 
 
 		 479 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0745  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.73 
 
 		 458 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.72 
 
 		 467 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.86 
 
 		 461 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3110  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3468  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4825  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.13 
 
 		 494 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0903  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0868  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0893  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 469 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.34 
 
 		 457 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5001  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.86 
 
 		 461 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5007  ATP-independent RNA helicase DbpA  43.54 
 
 		 459 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2040  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.39 
 
 		 468 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0752  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 467 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.748703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0897  ATP-dependent RNA helicase DbpA  49.18 
 
 		 458 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2042  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.39 
 
 		 468 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0516  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.54 
 
 		 473 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2949  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.79 
 
 		 470 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0690  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.99 
 
 		 469 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.43 
 
 		 469 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0647  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.88 
 
 		 464 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3852  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.99 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.02646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  48.63 
 
 		 459 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.1 
 
 		 478 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3216  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.64 
 
 		 467 aa  177  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.51 
 
 		 481 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3184  ATP-dependent RNA helicase DbpA  50.56 
 
 		 465 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2724  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.85 
 
 		 462 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.0215691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00762  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.17 
 
 		 459 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001711  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.66 
 
 		 459 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  48.63 
 
 		 465 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0146  ATP-dependent RNA helicase DbpA  47.03 
 
 		 462 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  41.45 
 
 		 457 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0948  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.52 
 
 		 468 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  41.71 
 
 		 459 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.69 
 
 		 438 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  47.54 
 
 		 474 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0189  ATP-dependent RNA helicase DbpA  47.54 
 
 		 460 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1428  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.39 
 
 		 490 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2804  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.57 
 
 		 460 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.72 
 
 		 460 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0253787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.63 
 
 		 463 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2843  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.72 
 
 		 460 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.7 
 
 		 457 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2027  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.7 
 
 		 457 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01320  ATP-dependent RNA helicase, specific for 23S rRNA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2300  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1557  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01330  hypothetical protein  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1460  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2282  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1992  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.639761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1779  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.24 
 
 		 457 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1778  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.77 
 
 		 457 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.77 
 
 		 457 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  46.77 
 
 		 457 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798131  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 		 607 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2143  ATP-dependent RNA helicase DbpA  45.7 
 
 		 457 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>