More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2130 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.02 
 
 		 976 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.7 
 
 		 962 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.56 
 
 		 991 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.44 
 
 		 1025 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 		 1025 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 		 1032 aa  636    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 1055 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42 
 
 		 967 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  40.32 
 
 		 1014 aa  666    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.36 
 
 		 1038 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  38.23 
 
 		 996 aa  637    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.53 
 
 		 968 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 		 1032 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.2 
 
 		 990 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.35 
 
 		 961 aa  672    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 		 1046 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.09 
 
 		 1009 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.07 
 
 		 976 aa  828    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.16 
 
 		 1034 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.05 
 
 		 990 aa  648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  41.31 
 
 		 1007 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  37.62 
 
 		 967 aa  674    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 1011 aa  666    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  44.76 
 
 		 952 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  39.52 
 
 		 1024 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.1 
 
 		 1023 aa  662    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  40.08 
 
 		 975 aa  740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.37 
 
 		 995 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  41 
 
 		 984 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.05 
 
 		 1015 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.67 
 
 		 978 aa  851    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.22 
 
 		 971 aa  685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  38.42 
 
 		 1070 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 973 aa  1977    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.47 
 
 		 983 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42 
 
 		 989 aa  709    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.76 
 
 		 990 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.9 
 
 		 977 aa  680    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  41.21 
 
 		 973 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.66 
 
 		 1005 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.37 
 
 		 1007 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  39.7 
 
 		 1024 aa  629  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  38.33 
 
 		 1013 aa  625  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.22 
 
 		 983 aa  622  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 		 1015 aa  618  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  41.04 
 
 		 974 aa  618  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.85 
 
 		 1035 aa  615  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  36.78 
 
 		 984 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.89 
 
 		 999 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 		 1023 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 999 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  35.21 
 
 		 930 aa  571  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  35.88 
 
 		 976 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.13 
 
 		 973 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 		 1052 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.68 
 
 		 1037 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.4 
 
 		 1022 aa  548  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 1050 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.09 
 
 		 1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.95 
 
 		 966 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 		 1043 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  36.65 
 
 		 987 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 		 976 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.63 
 
 		 1006 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.89 
 
 		 945 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 		 975 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.7 
 
 		 989 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  35 
 
 		 1000 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  35.19 
 
 		 997 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.12 
 
 		 974 aa  489  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.58 
 
 		 950 aa  486  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.59 
 
 		 948 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  34.07 
 
 		 1010 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.88 
 
 		 1050 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 		 985 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.27 
 
 		 997 aa  465  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.25 
 
 		 944 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  34.47 
 
 		 949 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  34.95 
 
 		 894 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 		 1006 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.64 
 
 		 906 aa  446  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 1002 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.5 
 
 		 947 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 		 1028 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.02 
 
 		 995 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.06 
 
 		 977 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 		 1027 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 		 993 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  31.47 
 
 		 1010 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  28.9 
 
 		 1013 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 1021 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  29.37 
 
 		 966 aa  402  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  30.65 
 
 		 1009 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 		 1019 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 1023 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 1020 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 		 1024 aa  399  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 		 1013 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>