More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2046 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  36.19 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  41.34 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 240 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  37.87 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  37.37 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  36.36 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  37.43 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  41.28 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  38.92 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  36.87 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 163 aa  99  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 		 159 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  38.86 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  35.75 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  33.87 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.08 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.09 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.43 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  32.96 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.5 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.72 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  30.81 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  34.83 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  30.73 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.89 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  35.43 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  32.42 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.74 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.08 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.74 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  31.98 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  33.33 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  32.12 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  30.22 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  32.96 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  31.95 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.75 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  27.92 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  32.4 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  32.4 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>