More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1118 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  58.59 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  41.45 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  47.4 
 
 		 154 aa  141  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  45.62 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  47.02 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  44.74 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  48.36 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  47.97 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  48.76 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  48.95 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  44 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  45.51 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  45.33 
 
 		 154 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  44.87 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  44.87 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  44.87 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  44.87 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  45.9 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  46.28 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  45.33 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  45.33 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  45.33 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  45.33 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  46.48 
 
 		 148 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  46.22 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  45.71 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  45.71 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  41.1 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  43.42 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  36.48 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  40.65 
 
 		 154 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  45 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  45.65 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  44.93 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  50.76 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  50.76 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  37.42 
 
 		 159 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 265 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.72 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  49.55 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.45 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.17 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.15 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  49.56 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  45.99 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  42.47 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>