255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5673 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
435 aa  893  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  51.71 
 
 
433 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
447 aa  135  1e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 
444 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
466 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
436 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  28.1 
 
 
442 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
455 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 
417 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.63 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
445 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.82 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
408 aa  85.9  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
432 aa  84  5e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.99418e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
412 aa  84  5e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
412 aa  84  5e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
485 aa  83.6  6e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
452 aa  82.4  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
408 aa  81.6  3e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
412 aa  80.9  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
455 aa  80.9  4e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
420 aa  80.1  8e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
435 aa  79.7  9e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
412 aa  79  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.37 
 
 
423 aa  77.4  5e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
544 aa  77  6e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
415 aa  77  6e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  23.53 
 
 
450 aa  76.3  9e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
410 aa  76.6  9e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
445 aa  76.3  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
415 aa  75.9  1e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
450 aa  75.1  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
440 aa  75.1  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
495 aa  75.5  2e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
414 aa  73.6  6e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
468 aa  73.9  6e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  23.4 
 
 
457 aa  71.6  2e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
410 aa  72  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 
415 aa  71.6  2e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.74 
 
 
427 aa  71.6  2e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
417 aa  71.2  3e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
452 aa  71.2  4e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
434 aa  70.1  6e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
420 aa  69.3  1e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
462 aa  68.6  2e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
432 aa  68.2  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.08 
 
 
413 aa  67.4  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
445 aa  67.4  5e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
416 aa  67.4  5e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 
399 aa  67.4  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 
412 aa  67  6e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
448 aa  67  6e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
449 aa  66.6  8e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 
428 aa  66.6  8e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 
445 aa  66.6  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 
442 aa  65.9  1e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
441 aa  65.9  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.27 
 
 
428 aa  66.2  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
428 aa  65.5  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
457 aa  65.5  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.84 
 
 
412 aa  65.5  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
433 aa  65.1  2e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
430 aa  64.7  3e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
414 aa  63.9  5e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
427 aa  63.9  5e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
441 aa  63.5  6e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
414 aa  63.9  6e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  20.64 
 
 
412 aa  63.5  7e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.67 
 
 
434 aa  63.2  9e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  22.04 
 
 
452 aa  62.8  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
424 aa  62.8  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
482 aa  62.8  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
414 aa  62.4  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
433 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
435 aa  62.4  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
424 aa  62  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
412 aa  61.6  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.29 
 
 
451 aa  62  2e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
414 aa  62  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
417 aa  62.4  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
434 aa  61.2  3e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
411 aa  61.2  3e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
453 aa  60.8  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
428 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>