255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5673 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  893    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  51.71 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  28.1 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.63 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.82 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.37 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  23.53 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  23.4 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.74 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.08 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.27 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.84 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  20.64 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.67 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  22.04 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.29 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.33 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>