More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5289 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  95.44 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.37 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  45.86 
 
 		 301 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  45.24 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  47.51 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  43.14 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  48.08 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.6 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  45.63 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  47.24 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.8 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  49.03 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  49.4 
 
 		 255 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  49.03 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  41.06 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  41.06 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6604  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  45.2 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.87 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5663  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  44 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.56 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.41 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 253 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.82 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.55 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  38.55 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.48 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  37.3 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>