293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4447 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  49.39 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  48.17 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  47.2 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  43.9 
 
 		 652 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  37.27 
 
 		 624 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  42.25 
 
 		 876 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  40.88 
 
 		 616 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  45.07 
 
 		 629 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  39.73 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.94 
 
 		 652 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 348 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 354 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 349 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.12 
 
 		 349 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 335 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 267 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 		 613 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 		 613 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 		 613 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  41.84 
 
 		 600 aa  97.8  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  36.65 
 
 		 617 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.37 
 
 		 270 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 219 aa  94.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 664 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.32 
 
 		 553 aa  94  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.3 
 
 		 224 aa  94  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 265 aa  92.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 263 aa  92.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 339 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 671 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 671 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  34.59 
 
 		 630 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 235 aa  91.3  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.31 
 
 		 671 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  36.02 
 
 		 617 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  37.97 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 263 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 288 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 265 aa  88.2  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  42.66 
 
 		 219 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 262 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 		 221 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 		 221 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  37.01 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  35.66 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  37.01 
 
 		 273 aa  80.9  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  36.59 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 219 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 219 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 313 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  32.02 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  32.17 
 
 		 390 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  30.91 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  32 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  32.65 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  31.47 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.16 
 
 		 279 aa  67.4  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>