More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2876 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  53.81 
 
 		 734 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  75.53 
 
 		 742 aa  1186    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 751 aa  1545    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  51.92 
 
 		 745 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  53.39 
 
 		 732 aa  767    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  53.91 
 
 		 732 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  54.76 
 
 		 736 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  78.75 
 
 		 753 aa  1170    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  75.53 
 
 		 742 aa  1186    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  55.04 
 
 		 734 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  37.03 
 
 		 747 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 759 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 759 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 777 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 720 aa  365  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 821 aa  362  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 710 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  32.66 
 
 		 753 aa  360  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 770 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 710 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 749 aa  348  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 732 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 733 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 722 aa  340  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 769 aa  334  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  33.78 
 
 		 772 aa  334  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 747 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 780 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 731 aa  330  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 707 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 719 aa  329  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  32.29 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  32.97 
 
 		 748 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 748 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 747 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 762 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 748 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 768 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 748 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 766 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 753 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 792 aa  323  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 733 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 733 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 731 aa  320  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 763 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 730 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 730 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 730 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 730 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  32.17 
 
 		 730 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 731 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 773 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 731 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 826 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 794 aa  303  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 724 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 739 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 740 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 737 aa  297  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 715 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 815 aa  289  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 767 aa  286  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 759 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 760 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 727 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 757 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  31.12 
 
 		 754 aa  277  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 706 aa  277  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 706 aa  277  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 803 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.89 
 
 		 695 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.92 
 
 		 743 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 741 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 776 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.79 
 
 		 760 aa  257  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 760 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  27.89 
 
 		 760 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  27.89 
 
 		 760 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.65 
 
 		 760 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.65 
 
 		 760 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.65 
 
 		 760 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 769 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.52 
 
 		 760 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 764 aa  252  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 823 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 755 aa  251  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 793 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>