More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1252 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  83.96 
 
 
271 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  68.4 
 
 
274 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  69.52 
 
 
274 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  69.14 
 
 
274 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  60.44 
 
 
277 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  55.4 
 
 
281 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  60.95 
 
 
277 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  56.02 
 
 
270 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  54.1 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 
272 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 
268 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  51.62 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  51.64 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  52.27 
 
 
260 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
269 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  50.38 
 
 
260 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 
269 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  52.27 
 
 
260 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  48.48 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  47.35 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 
287 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
263 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.06 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.9 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.71 
 
 
370 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.2 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.2 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.67 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
323 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  27.71 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
390 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.72 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.76 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.28 
 
 
571 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.39 
 
 
371 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.42 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
423 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
289 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.68 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.68 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  26.98 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.68 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
335 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.8 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  23.91 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.44 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  23.79 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  25.86 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.91 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>