141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2538 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  78.41 
 
 		 688 aa  1068    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 693 aa  1399    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  40.9 
 
 		 670 aa  333  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  38.84 
 
 		 669 aa  327  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  29.46 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  31.22 
 
 		 475 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.31 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  27.71 
 
 		 535 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  28.14 
 
 		 545 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 		 539 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  28.36 
 
 		 540 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  28.02 
 
 		 527 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  27.91 
 
 		 535 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  28.41 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  30.12 
 
 		 668 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  27.7 
 
 		 539 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 		 546 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  29.71 
 
 		 517 aa  185  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  28.26 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  28.75 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  34.51 
 
 		 656 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  29.48 
 
 		 485 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  27.53 
 
 		 532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 		 680 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 507 aa  173  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  28.48 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  30.69 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  28.31 
 
 		 511 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  28.05 
 
 		 533 aa  150  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  27.64 
 
 		 513 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  37.25 
 
 		 740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  31.1 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.85 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  27.23 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  27.23 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  27.23 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  27.29 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  27.29 
 
 		 508 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  27.29 
 
 		 508 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  26.04 
 
 		 542 aa  92.8  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 505 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  24 
 
 		 520 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  24.9 
 
 		 522 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  25.05 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.25 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.24 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  26.67 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  24.31 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.27 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.71 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  25.72 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  26.02 
 
 		 551 aa  80.9  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.94 
 
 		 520 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  25.76 
 
 		 518 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  23.99 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 675 aa  78.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  22.91 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  22.44 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.76 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.84 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  31.33 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  23.91 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  24.89 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  26.94 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.69 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  22.2 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  23.95 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.25 
 
 		 516 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  23.83 
 
 		 521 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  22.37 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  23.18 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  31.92 
 
 		 520 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  22.53 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  24.27 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  21.96 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.72 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.21 
 
 		 518 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  27.61 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.88 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  22.88 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  24.52 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  24.03 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.27 
 
 		 523 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.89 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  25.27 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  25.4 
 
 		 572 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  23.97 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  22.8 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.29 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>