23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1915 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1184    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  26.24 
 
 		 670 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  25.71 
 
 		 669 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  29.83 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 		 480 aa  57  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  24.55 
 
 		 688 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 612 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  22.25 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  24.56 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  26.44 
 
 		 740 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  26.67 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  25.4 
 
 		 693 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.71 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  25.21 
 
 		 533 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 		 507 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.62 
 
 		 668 aa  47.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  26.64 
 
 		 656 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  21.06 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  27.08 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  27.08 
 
 		 545 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  27.08 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  26.56 
 
 		 517 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>