More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0719 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  100 
 
 
168 aa  342  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  83.93 
 
 
168 aa  269  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  73.29 
 
 
164 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  51.22 
 
 
182 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  58.64 
 
 
165 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.65 
 
 
179 aa  184  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  54.09 
 
 
165 aa  180  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 
162 aa  177  5e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  52.47 
 
 
166 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.95843e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
164 aa  170  8e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.17 
 
 
165 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  54 
 
 
159 aa  162  2e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.83978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.41 
 
 
163 aa  162  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.94 
 
 
167 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.54 
 
 
164 aa  158  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.65 
 
 
164 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  46.2 
 
 
161 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  52 
 
 
156 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.89 
 
 
184 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.34 
 
 
160 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  50.33 
 
 
172 aa  147  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.64662e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
164 aa  146  1e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 
164 aa  144  7e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.3 
 
 
162 aa  144  8e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 
157 aa  143  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 
164 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 
164 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 
164 aa  139  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 
161 aa  138  4e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 
171 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
158 aa  137  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.67 
 
 
176 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 
157 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
173 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.37 
 
 
183 aa  134  7e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  44.67 
 
 
180 aa  134  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.71 
 
 
171 aa  132  2e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.24 
 
 
192 aa  131  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 
157 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.99 
 
 
166 aa  130  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.37 
 
 
164 aa  129  1e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.63 
 
 
165 aa  130  1e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 
157 aa  129  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.64 
 
 
166 aa  129  2e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.53 
 
 
178 aa  129  2e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.67 
 
 
200 aa  129  2e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  42.42 
 
 
180 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.4 
 
 
167 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
168 aa  128  4e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
168 aa  128  4e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.66 
 
 
174 aa  127  8e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  47.3 
 
 
163 aa  127  9e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 
157 aa  126  1e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
167 aa  126  1e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
169 aa  126  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.75 
 
 
189 aa  127  1e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 
202 aa  126  1e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  38.69 
 
 
154 aa  125  2e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 
182 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.92 
 
 
173 aa  125  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  46.01 
 
 
165 aa  124  4e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  41.76 
 
 
182 aa  124  4e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  46.01 
 
 
165 aa  124  4e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46 
 
 
165 aa  124  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  38.69 
 
 
154 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.51 
 
 
167 aa  124  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  46 
 
 
165 aa  124  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  47.29 
 
 
172 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 
157 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
197 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.05 
 
 
173 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
166 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
173 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  46.51 
 
 
173 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  46.51 
 
 
173 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.94 
 
 
173 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 
186 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 
186 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.37 
 
 
191 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
173 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  38 
 
 
200 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 
158 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
183 aa  120  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
183 aa  120  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
154 aa  119  1e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  40 
 
 
182 aa  119  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  119  2e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  119  2e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
180 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  43.56 
 
 
168 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 
194 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  47.74 
 
 
185 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 
158 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.14 
 
 
165 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 
180 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>