87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1230 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1230  CHAD  100 
 
 		 328 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  67.99 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  55.15 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  44.34 
 
 		 329 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  36.11 
 
 		 512 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.22 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.22 
 
 		 512 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  34.66 
 
 		 511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  32.41 
 
 		 513 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  33.66 
 
 		 508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  34.28 
 
 		 508 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 508 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  34.25 
 
 		 511 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  35.29 
 
 		 510 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  36.03 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.27 
 
 		 505 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.65 
 
 		 510 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  35.55 
 
 		 490 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.84 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  34.23 
 
 		 494 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.16 
 
 		 596 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  29.1 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  29.63 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.27 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.71 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  27.8 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.46 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.02 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.82 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.82 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  31.22 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.82 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  30.66 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  31.56 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31.06 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.45 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.97 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.95 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.8 
 
 		 640 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 		 640 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 		 640 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  35.34 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.8 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.8 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  29.48 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  28.74 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.07 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  29.66 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  34.09 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  26.37 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  27.54 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  31.09 
 
 		 643 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  41.67 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  29.15 
 
 		 505 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  29.24 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  23.96 
 
 		 920 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.66 
 
 		 555 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  27.14 
 
 		 539 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.84 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.86 
 
 		 527 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.76 
 
 		 505 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.64 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.05 
 
 		 534 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  28.21 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  27.91 
 
 		 719 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.5 
 
 		 524 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  30.42 
 
 		 498 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.86 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.15 
 
 		 490 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.02 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  23.85 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  24.01 
 
 		 558 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  28.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  26.74 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  24.77 
 
 		 492 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.14 
 
 		 509 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  22.59 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.78 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.21 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  28.5 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  27.73 
 
 		 522 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  21.48 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>