More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0100 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  69.13 
 
 
602 aa  891  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
591 aa  859  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54 
 
 
604 aa  644  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.72 
 
 
591 aa  860  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.72 
 
 
591 aa  860  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.87 
 
 
592 aa  877  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  98.7 
 
 
616 aa  1271  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.72 
 
 
587 aa  645  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.92 
 
 
590 aa  665  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.72 
 
 
591 aa  859  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  72.37 
 
 
598 aa  922  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.08 
 
 
590 aa  661  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.69 
 
 
601 aa  892  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
591 aa  859  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.5 
 
 
604 aa  638  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  71 
 
 
602 aa  905  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.67 
 
 
592 aa  876  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.05 
 
 
591 aa  864  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.08 
 
 
601 aa  875  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.55 
 
 
587 aa  642  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  72.2 
 
 
597 aa  917  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  69.07 
 
 
601 aa  874  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  68.86 
 
 
601 aa  885  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  72.37 
 
 
596 aa  915  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
591 aa  859  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
591 aa  860  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.63 
 
 
605 aa  637  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.83 
 
 
592 aa  879  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.63 
 
 
603 aa  639  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.61 
 
 
616 aa  1156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.41 
 
 
590 aa  639  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.93 
 
 
590 aa  650  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.83 
 
 
594 aa  664  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  58.9 
 
 
587 aa  708  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.07 
 
 
601 aa  874  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.43 
 
 
590 aa  652  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  55.15 
 
 
584 aa  661  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.05 
 
 
587 aa  654  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.82 
 
 
592 aa  884  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.67 
 
 
592 aa  873  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
616 aa  1283  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  60.23 
 
 
594 aa  748  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  61.9 
 
 
597 aa  756  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.7 
 
 
603 aa  646  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
589 aa  661  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
589 aa  661  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.1 
 
 
590 aa  649  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.15 
 
 
592 aa  887  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.26 
 
 
602 aa  915  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
591 aa  860  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.35 
 
 
596 aa  635  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.94 
 
 
591 aa  853  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.94 
 
 
591 aa  853  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.15 
 
 
592 aa  887  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.93 
 
 
590 aa  650  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.83 
 
 
591 aa  862  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.89 
 
 
592 aa  859  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.28 
 
 
591 aa  640  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.15 
 
 
592 aa  887  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.57 
 
 
595 aa  692  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.15 
 
 
592 aa  887  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.22 
 
 
591 aa  866  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.93 
 
 
590 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.59 
 
 
590 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.39 
 
 
595 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.38 
 
 
605 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.88 
 
 
605 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.91 
 
 
588 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.05 
 
 
596 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.72 
 
 
605 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.91 
 
 
598 aa  625  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.27 
 
 
596 aa  624  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.43 
 
 
590 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.92 
 
 
590 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.75 
 
 
590 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.75 
 
 
590 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.7 
 
 
611 aa  618  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  52.37 
 
 
638 aa  615  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.69 
 
 
596 aa  618  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.78 
 
 
596 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.05 
 
 
595 aa  618  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.22 
 
 
587 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.7 
 
 
611 aa  613  1e-174  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.3 
 
 
596 aa  615  1e-174  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.97 
 
 
612 aa  614  1e-174  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.2 
 
 
608 aa  612  1e-174  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.03 
 
 
600 aa  609  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.41 
 
 
612 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  54.95 
 
 
637 aa  608  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.03 
 
 
608 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.28 
 
 
590 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.93 
 
 
606 aa  608  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.86 
 
 
602 aa  607  1e-172  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.86 
 
 
600 aa  605  1e-172  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>