71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1430 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  703    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  29.77 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  30.29 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2750  uroporphyrinogen decarboxylase  27.21 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.57 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.35 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  22.79 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2103  uroporphyrinogen decarboxylase  27.97 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00554652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  23.65 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.29 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  23.19 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.4 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  22.03 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.22 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.48 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.15 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  22.97 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.96 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  22.38 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  26.32 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  23.42 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.5 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  22.38 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.14 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.74 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  21.01 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.79 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  22.05 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.14 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.99 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.94 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  25.51 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  23.14 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.7 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.22 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  22.08 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  23.96 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  25.36 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  24.9 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  24.49 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  24.32 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  19.42 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  23.85 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.51 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  23.74 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1604  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000195543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  26.64 
 
 		 354 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  26.28 
 
 		 354 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  26.28 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  22.79 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  24.63 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  25.91 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  21.29 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  23.17 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  23.17 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  22.47 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.32 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  20.38 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  21.49 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  24 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  23.17 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  21.29 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  24.63 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  22.76 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  21.59 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  26.5 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>