More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1689 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  67.02 
 
 		 193 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  59.47 
 
 		 188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  58.85 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  54.21 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  47.37 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  42.93 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  41.88 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  41.88 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  40.84 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  34.04 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  30.11 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  59.09 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  29.09 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  28.35 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  27.67 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  26.7 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  30.48 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  25.65 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  25.65 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  27.69 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.44 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.32 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  29.58 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.65 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  26.48 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.94 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  27.61 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  27.27 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.73 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  23.89 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.31 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.49 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.8 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  28.49 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.14 
 
 		 283 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  27.37 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  29.1 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  31.01 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.26 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.94 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  25.9 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2334  phage integrase family protein  30 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113164 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.91 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.91 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.91 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  27.65 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  26.37 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  24.86 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 325 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  28.03 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  25.73 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  25.73 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  25.73 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  29.3 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 311 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  29.73 
 
 		 295 aa  54.3  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  24.69 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  24.74 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  24.74 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.94 
 
 		 295 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25 
 
 		 400 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  28.74 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>