More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1393 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  71.91 
 
 		 235 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  37.28 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  36.89 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  39.01 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  36.89 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  38.46 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  35.37 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  33.76 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  34.06 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  32.91 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  32.31 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  39.65 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  30.87 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  36.68 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  33.33 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.34 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  28.34 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.78 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  32.05 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  38.94 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  30.8 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  38.57 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  36.12 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  32.26 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  31.93 
 
 		 365 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  32.41 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  31.51 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 351 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.25 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.93 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  34 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  30.33 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  30.56 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  30.58 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 364 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  33.33 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  28.16 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  30 
 
 		 409 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.2 
 
 		 329 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  26.56 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 496 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  32.71 
 
 		 362 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.73 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 		 386 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  31.34 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  34.05 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  32.55 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  31.05 
 
 		 374 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  29.26 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  29.51 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  31.72 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  29.2 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  30.33 
 
 		 310 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  29.03 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  30.69 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  29.1 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  30.14 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  28.75 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  25.85 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  26.67 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.53 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  26.4 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 397 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  30.77 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  28.12 
 
 		 320 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 341 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1053  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.588648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  27.83 
 
 		 341 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  28.44 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  32.08 
 
 		 300 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  27.87 
 
 		 341 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  31.43 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  31.08 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  28.18 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  29.91 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  27.97 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>