More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3833 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  68.44 
 
 		 249 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  68.02 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  69.42 
 
 		 249 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  68.95 
 
 		 255 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  69.23 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  68.42 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  68.15 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  64.4 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  65.95 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  64.26 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  63.98 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  63.98 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  63.98 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  61.51 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  56.85 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  63.98 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  63.98 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  58.59 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  61.09 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  60.94 
 
 		 246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.39 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  57.31 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  54.84 
 
 		 256 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  58.4 
 
 		 260 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  59.84 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  59.2 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  61.8 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  60.17 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.07 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  55.47 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  55.12 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  54.69 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  55.98 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.15 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  54.15 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  54.37 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.55 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  52.72 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  53.57 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  53.49 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  53.64 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  51.08 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.08 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.08 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  46.64 
 
 		 572 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  46.4 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 339 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  51.3 
 
 		 575 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  50.66 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  50.22 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.91 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0709031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.58 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  48.54 
 
 		 541 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0949  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  46.72 
 
 		 323 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0807  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  52.04 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.15 
 
 		 355 aa  204  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 339 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 		 343 aa  204  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1000  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.90335e-62 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.72 
 
 		 571 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  43.02 
 
 		 686 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0892  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.915711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  52.04 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1004  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0863  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.29 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0826  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0811  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0912  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.29 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4382  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  46.29 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.73 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  48.55 
 
 		 543 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3795  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.330275 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.09 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>