More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1885 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 587 aa  1220    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  52.87 
 
 		 604 aa  595  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  52.21 
 
 		 601 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  48.16 
 
 		 581 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  47.11 
 
 		 650 aa  508  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  46.17 
 
 		 581 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  46.79 
 
 		 648 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  44.1 
 
 		 585 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  42.93 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  37.61 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  33.94 
 
 		 563 aa  317  4e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.12 
 
 		 601 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.82 
 
 		 564 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.39 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  30.05 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.39 
 
 		 575 aa  217  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.87 
 
 		 584 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 545 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.05 
 
 		 574 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.52 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.85 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 545 aa  193  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.46 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.58 
 
 		 564 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 546 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 547 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.44 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 542 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.57 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.97 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.72 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  28.11 
 
 		 547 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  28.15 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.91 
 
 		 539 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 589 aa  170  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 590 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.44 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.97 
 
 		 540 aa  163  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.8 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.11 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 556 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.77 
 
 		 579 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.58 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.58 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.93 
 
 		 560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 565 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 549 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 583 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 618 aa  150  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.65 
 
 		 543 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  25.22 
 
 		 568 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.28 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  27.77 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 543 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 544 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 616 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.77 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.08 
 
 		 550 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.04 
 
 		 543 aa  144  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  27.43 
 
 		 576 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.54 
 
 		 537 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  25.93 
 
 		 565 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 532 aa  140  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.72 
 
 		 522 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  25.93 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>