More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0093 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 521 aa  1077    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  60.64 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  58.73 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  58.93 
 
 		 523 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  58.73 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  56.85 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  55.45 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  56.65 
 
 		 519 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 		 512 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 518 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  56.57 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.72 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 		 525 aa  538  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  54.71 
 
 		 541 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.91 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.32 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  54.93 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 530 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  54.49 
 
 		 541 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  52.28 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  51.69 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  53.65 
 
 		 521 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 		 516 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  52.63 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 555 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 520 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 523 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  52.35 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  53.07 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  52.84 
 
 		 519 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 524 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  52.47 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 527 aa  511  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 522 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.25 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  50.57 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 522 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  51.69 
 
 		 520 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  52.33 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  51.25 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  52.04 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  51.38 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  51.67 
 
 		 529 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 529 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 		 513 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 		 513 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 523 aa  498  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 527 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  52.06 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 529 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 568 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.06 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>