More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0086 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  100 
 
 
316 aa  649  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  81.15 
 
 
316 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  80.19 
 
 
316 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  80.13 
 
 
316 aa  516  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  79.23 
 
 
316 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  74.69 
 
 
319 aa  495  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  71.92 
 
 
317 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  71.92 
 
 
317 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  71.92 
 
 
317 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  72.87 
 
 
338 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  72.56 
 
 
338 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  72.56 
 
 
317 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  71.92 
 
 
317 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  71.61 
 
 
317 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  72.24 
 
 
317 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  72.24 
 
 
317 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  70.98 
 
 
317 aa  469  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  71.29 
 
 
317 aa  470  1e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  71.29 
 
 
317 aa  470  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  71.29 
 
 
317 aa  468  1e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  71.29 
 
 
317 aa  468  1e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  70.29 
 
 
317 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  67.95 
 
 
318 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  68.27 
 
 
318 aa  446  1e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.61015e-05  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  68.27 
 
 
318 aa  446  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  68.27 
 
 
318 aa  446  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  67.31 
 
 
318 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.40039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  67.31 
 
 
318 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  67.31 
 
 
318 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  67.63 
 
 
318 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  67.31 
 
 
318 aa  441  1e-122  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  66.46 
 
 
320 aa  440  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  67.63 
 
 
318 aa  440  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.75704e-05  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  66.46 
 
 
318 aa  439  1e-122  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  67.95 
 
 
317 aa  439  1e-122  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  67.61 
 
 
318 aa  439  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  65.51 
 
 
318 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.01503e-07  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  65.71 
 
 
317 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  67.41 
 
 
316 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.43642e-07  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  66.03 
 
 
317 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  65.81 
 
 
317 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  64.35 
 
 
319 aa  415  1e-115  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  63.61 
 
 
316 aa  414  1e-115  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  63.78 
 
 
316 aa  416  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  63.46 
 
 
316 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  65.06 
 
 
316 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  62.18 
 
 
316 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  61.54 
 
 
316 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  62.82 
 
 
316 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  62.18 
 
 
316 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  62.5 
 
 
316 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  62.5 
 
 
316 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  62.82 
 
 
316 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  58.33 
 
 
318 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  59.11 
 
 
308 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  58.92 
 
 
308 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  59.24 
 
 
308 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  2.13936e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  58.28 
 
 
322 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  57.05 
 
 
321 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  58.28 
 
 
322 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  59.63 
 
 
310 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.65093e-10  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  58.6 
 
 
308 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  58.92 
 
 
308 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  58.28 
 
 
307 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  58.62 
 
 
313 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0076  transaldolase A  54.43 
 
 
317 aa  362  4e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  57.51 
 
 
309 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  56.23 
 
 
326 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  57.78 
 
 
316 aa  359  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  57.14 
 
 
321 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  56.73 
 
 
321 aa  356  3e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.39 
 
 
390 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.35 
 
 
390 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.28 
 
 
390 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  56.78 
 
 
333 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.99 
 
 
387 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.99 
 
 
387 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  54.86 
 
 
318 aa  350  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  57.98 
 
 
333 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  55.24 
 
 
324 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.73 
 
 
392 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  58.31 
 
 
333 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  57.47 
 
 
339 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>