More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0297 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  41.16 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  40.27 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.44 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.22 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  35.38 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 		 318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  34.13 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  34.13 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  32.33 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 313 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  30.74 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  31.97 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  34.57 
 
 		 345 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  32.65 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  31.69 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  29.82 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  29.82 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  31.82 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  30.23 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  32.45 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  30.23 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  31.87 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  30.9 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  30.9 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  33.62 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 443 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47531  Heme A farnesyltransferase  30.72 
 
 		 452 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695562  normal  0.861944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  31.87 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  31.87 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  37.17 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  30.67 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  33.18 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  37.17 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  30.56 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  34.14 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  34.56 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  31.27 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  31.27 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  29.72 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  32.48 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  29.74 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  31.86 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  30.45 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  30.45 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  30.88 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  30.8 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  32.34 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  32.8 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  33.73 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  31.38 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  32.33 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.01 
 
 		 622 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  34.05 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  31.09 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  27.65 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  31.65 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>