More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1448 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  73.7 
 
 		 308 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  73.38 
 
 		 308 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  73.38 
 
 		 308 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  75.97 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  72.19 
 
 		 303 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  72.19 
 
 		 303 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  63.99 
 
 		 314 aa  341  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.7 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.01 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  53.77 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  51.53 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  51.5 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  52.46 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  53.97 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.34 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  47.83 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  50.67 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  48.73 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  47.7 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  49.36 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  49.36 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  49.04 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  47.99 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  47.37 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  47.04 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  49.04 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  46.62 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  47.54 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  50.22 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  50.22 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  42.52 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  49.16 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  41.84 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  40.79 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  39.42 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  39.1 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.58 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  41.78 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.82 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  38.62 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  39.24 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.65 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  40.58 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  36.01 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  35.82 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  33.46 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  34.05 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  27.41 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.35 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.99 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  31.29 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.74 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.62 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.82 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  24.32 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  30.57 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.13 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.46 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.03 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.5 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.49 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  28.83 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.26 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  29.13 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  27.91 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.54 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  28.5 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.98 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.01 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  25.67 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.91 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  25.27 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  26.59 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  34.68 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  26.38 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  30.62 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25.23 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>