More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3705 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  62.68 
 
 		 302 aa  384  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  61.62 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  59.53 
 
 		 301 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  42.86 
 
 		 301 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  48.47 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  34.05 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  35.57 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  36.49 
 
 		 291 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  37.7 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.44 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.67 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.01 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.78 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.02 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  30.96 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  33.66 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  36.6 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.84 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.01 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>