More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2465 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  850    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  71.43 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  55.73 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  55.44 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  54.66 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  56.91 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  53.18 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  53.83 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  52.41 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  46.58 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  45.53 
 
 		 449 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  45.26 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  44.99 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  44.08 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  39.47 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  37.02 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37.83 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  39.53 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  39.53 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.54 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  36.88 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  37.59 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  34.9 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  37.53 
 
 		 433 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  37.8 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  37.8 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  37.53 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  39.43 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  39.14 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  39.14 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  38.85 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  39.14 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  34.46 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  35.22 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.22 
 
 		 458 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  37.37 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  37.04 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  38.58 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  30.65 
 
 		 469 aa  209  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  31.89 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  41.1 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  32.92 
 
 		 511 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  41.12 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  41.12 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  40.19 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.97 
 
 		 494 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  39.72 
 
 		 291 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.73 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  38.66 
 
 		 290 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  37.84 
 
 		 261 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  36.53 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.33 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  30.48 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.87 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  34.76 
 
 		 271 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  35.02 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  28.65 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  28.17 
 
 		 536 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.58 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  28.17 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  36.04 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.51 
 
 		 258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.36 
 
 		 258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.36 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.66 
 
 		 571 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  29.66 
 
 		 552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  29.66 
 
 		 552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  39.51 
 
 		 252 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  39.51 
 
 		 252 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  33.33 
 
 		 257 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.65 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.4 
 
 		 571 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  29.4 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.4 
 
 		 552 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.4 
 
 		 552 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  38.27 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  38.27 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  38.27 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  37.11 
 
 		 258 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  36.48 
 
 		 255 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  36.48 
 
 		 255 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  34.91 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  29.57 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>