210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2952 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  64.52 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  57.78 
 
 		 105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  62.79 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  60 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  56.84 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  55.43 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  60.26 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  61.43 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  60 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  41.3 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  50.77 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 183 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  52 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  49.02 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  48.98 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.31 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.31 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  51.16 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  48 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  48 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  50 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  44.78 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 194 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  55.81 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  44.07 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  48 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 459 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  48 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  45 
 
 		 459 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  50 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  44 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  44 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1048  HNH endonuclease  48.08 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  47.06 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 552 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  55.81 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.26 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  41.51 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  48 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  46 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  46 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  48 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  46.43 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  44.07 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  42 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  38.24 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  36.76 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  32.89 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  45.1 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  43.33 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  42.86 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  32.89 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  36.21 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  51.16 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 216 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  47.06 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  45.83 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  38.24 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>