189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1048 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1048  HNH endonuclease  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  40.1 
 
 
205 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  34.16 
 
 
198 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  34.16 
 
 
198 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  34.16 
 
 
197 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  33.17 
 
 
204 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  30.2 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  33.01 
 
 
198 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  45.16 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  32.24 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  32.24 
 
 
168 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.59 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  36.89 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  37.29 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  31.18 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  36.23 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  36.23 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.64 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  34.39 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  32.48 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  31.72 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  33.76 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  37.4 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  34.39 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  35.51 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  32.77 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  32.24 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  32.85 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  31.78 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  33.55 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  31.32 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  34.55 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  36.44 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  36.44 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  34.55 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  35.92 
 
 
166 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  36.79 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  32.89 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  32.89 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  42.17 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  32.89 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  32.12 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  35.43 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  33.86 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  35.67 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  34.23 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  37.18 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.45 
 
 
167 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  30.95 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  31.62 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  35.45 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  31.17 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  34.53 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  39.29 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  40.96 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  34.53 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  41.35 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  37.29 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  37.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  32.48 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  30.56 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  34.75 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  34.55 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  34.75 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  38.39 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  35.45 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  29.13 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  37.18 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  33.16 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  34.75 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  33.59 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  35.33 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  38.32 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  35.45 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  36.36 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  36.36 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  31.62 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  32.12 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  34.55 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  32.12 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  37.27 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  34.78 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  34.11 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  31.82 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  35 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  31.29 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  32.73 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  33.58 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  32.37 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  30 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  39.74 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  35.45 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  35.04 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  34.44 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  34.44 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  34.44 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  33.05 
 
 
165 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44 
 
 
146 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  36.11 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  30.39 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>