More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2262 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  100 
 
 
333 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  47.51 
 
 
350 aa  335  6e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  52.81 
 
 
350 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  52.81 
 
 
350 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  53.33 
 
 
378 aa  302  6e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  43.77 
 
 
366 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  8.73771e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  43.85 
 
 
357 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  41.18 
 
 
318 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  42.77 
 
 
329 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  39.82 
 
 
388 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  38.62 
 
 
360 aa  226  5e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.91 
 
 
359 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  39.63 
 
 
387 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  36 
 
 
322 aa  216  6e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  39.67 
 
 
368 aa  214  2e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  39.04 
 
 
385 aa  214  2e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.2 
 
 
378 aa  214  2e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  40 
 
 
389 aa  214  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  37.69 
 
 
382 aa  213  3e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  37.2 
 
 
385 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  39.45 
 
 
383 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  40 
 
 
390 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  38.49 
 
 
383 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  39.18 
 
 
309 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  39.04 
 
 
379 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  40 
 
 
361 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  38.71 
 
 
387 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  41.67 
 
 
306 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  37.07 
 
 
407 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.21 
 
 
389 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  36.7 
 
 
394 aa  201  1e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.18 
 
 
395 aa  199  4e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.51 
 
 
403 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  36.69 
 
 
379 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  40.64 
 
 
329 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.89 
 
 
405 aa  198  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  37.18 
 
 
389 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  40 
 
 
382 aa  196  5e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  36.81 
 
 
386 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  37.91 
 
 
308 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  37.91 
 
 
308 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  37.67 
 
 
419 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  33.33 
 
 
311 aa  189  4e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.67 
 
 
393 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  2.32279e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  38.18 
 
 
394 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  37.33 
 
 
419 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  37.63 
 
 
393 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  34.49 
 
 
347 aa  187  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  5.64548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  37.63 
 
 
393 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.36 
 
 
436 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
421 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  36.99 
 
 
419 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  36.36 
 
 
475 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.27 
 
 
395 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.71 
 
 
331 aa  184  1e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.58 
 
 
477 aa  184  2e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  35.53 
 
 
376 aa  184  2e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  37.58 
 
 
382 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  36.81 
 
 
447 aa  182  5e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  33.44 
 
 
395 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  37.11 
 
 
399 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.79 
 
 
418 aa  180  3e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  35.25 
 
 
382 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  35.22 
 
 
420 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  35.25 
 
 
382 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.21 
 
 
393 aa  179  5e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.32 
 
 
447 aa  179  5e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.71 
 
 
407 aa  179  5e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.43 
 
 
457 aa  179  5e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  34.33 
 
 
503 aa  179  6e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  35.41 
 
 
398 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  31.8 
 
 
355 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  34.07 
 
 
420 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  34.77 
 
 
401 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.01 
 
 
399 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  35.22 
 
 
379 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  37.46 
 
 
394 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.88 
 
 
498 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  34 
 
 
357 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  34.12 
 
 
433 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.27 
 
 
406 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.18 
 
 
393 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.18 
 
 
405 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  35.56 
 
 
413 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  36 
 
 
379 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  36 
 
 
379 aa  175  1e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.2736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.44 
 
 
401 aa  175  1e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  36 
 
 
379 aa  175  1e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.88714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  36 
 
 
379 aa  175  1e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.65537e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>