More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0825 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.26 
 
 		 712 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  100 
 
 		 733 aa  1514    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  43.24 
 
 		 717 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  43.48 
 
 		 905 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  52.45 
 
 		 904 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  47.58 
 
 		 875 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  50 
 
 		 893 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  47.24 
 
 		 864 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 762 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  48.06 
 
 		 902 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  45.91 
 
 		 882 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.29 
 
 		 756 aa  362  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  45.66 
 
 		 882 aa  360  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  45.07 
 
 		 881 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 807 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.15 
 
 		 889 aa  357  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.83 
 
 		 808 aa  349  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  34.47 
 
 		 763 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.13 
 
 		 777 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.86 
 
 		 738 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.37 
 
 		 790 aa  343  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 		 754 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 		 747 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.58 
 
 		 755 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 763 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  47.61 
 
 		 849 aa  336  7.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.54 
 
 		 765 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.68 
 
 		 755 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.54 
 
 		 755 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.54 
 
 		 755 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 778 aa  335  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 		 769 aa  335  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  36.19 
 
 		 772 aa  334  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.98 
 
 		 774 aa  333  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 769 aa  333  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 799 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 778 aa  333  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.67 
 
 		 1212 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 792 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 		 801 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.19 
 
 		 766 aa  330  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.14 
 
 		 763 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.67 
 
 		 765 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.67 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.67 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 1343 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.67 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 		 765 aa  328  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33 
 
 		 763 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  33.9 
 
 		 859 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.67 
 
 		 765 aa  328  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.67 
 
 		 765 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 		 750 aa  327  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 		 760 aa  327  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.52 
 
 		 765 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 		 751 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.8 
 
 		 1357 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.71 
 
 		 763 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 		 753 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 		 768 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  32.28 
 
 		 803 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  32.48 
 
 		 768 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.03 
 
 		 772 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.52 
 
 		 765 aa  323  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  34.1 
 
 		 1037 aa  323  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  32.2 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.27 
 
 		 772 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  32.86 
 
 		 763 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 		 768 aa  319  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 		 782 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.82 
 
 		 765 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.23 
 
 		 739 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 		 784 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.04 
 
 		 771 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.29 
 
 		 740 aa  312  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.91 
 
 		 1548 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  32.49 
 
 		 764 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  32.4 
 
 		 762 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.74 
 
 		 743 aa  310  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.53 
 
 		 755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  35.66 
 
 		 765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  32.26 
 
 		 764 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.86 
 
 		 783 aa  307  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.07 
 
 		 737 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 		 766 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  32.18 
 
 		 759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 		 721 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.61 
 
 		 752 aa  300  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  41.6 
 
 		 898 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 		 743 aa  300  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.18 
 
 		 773 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 		 733 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 		 757 aa  294  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 		 702 aa  295  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.15 
 
 		 757 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 		 804 aa  292  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.46 
 
 		 724 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.54 
 
 		 762 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>