168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0711 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  51.49 
 
 		 285 aa  278  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  48.51 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  44.57 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  43.07 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  43.64 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  42.73 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  30.53 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  26.85 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  23.7 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 359 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  22.26 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  22.43 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  23.66 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  25.77 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30.72 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1570  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  26.63 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  26.63 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  24.12 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  21.97 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  21.97 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  22.93 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  28.95 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  25.5 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  24.65 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  24.34 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.53 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  20.22 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  24.42 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 		 448 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  22.35 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  27.33 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  24.24 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  20 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>