More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0426 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  83.07 
 
 
451 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  83.3 
 
 
451 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  100 
 
 
450 aa  920    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  97.33 
 
 
450 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  82.63 
 
 
451 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  86.58 
 
 
451 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  74.72 
 
 
455 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  76.46 
 
 
448 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  83.07 
 
 
451 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  75.06 
 
 
465 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  75.06 
 
 
465 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  48.32 
 
 
441 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  49.64 
 
 
466 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  48.08 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  47.86 
 
 
453 aa  405  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  46.59 
 
 
470 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  43.78 
 
 
459 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  47.96 
 
 
459 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  45.85 
 
 
453 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  41.47 
 
 
459 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  42.65 
 
 
442 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  42.63 
 
 
465 aa  361  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.78 
 
 
452 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  42.69 
 
 
493 aa  360  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  47.03 
 
 
443 aa  358  8e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  42 
 
 
530 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  42.56 
 
 
489 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.72 
 
 
506 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  42.45 
 
 
504 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  41.36 
 
 
454 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  41.36 
 
 
455 aa  347  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  43.05 
 
 
460 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  40.24 
 
 
477 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  45.3 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  39.76 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  40.76 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  43.27 
 
 
470 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
492 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  40.62 
 
 
484 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  39.52 
 
 
433 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  40.86 
 
 
484 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.27 
 
 
453 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  39.53 
 
 
484 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  38.01 
 
 
499 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  39.07 
 
 
447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  38.68 
 
 
433 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  38.68 
 
 
433 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  40.66 
 
 
479 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  38.41 
 
 
493 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  38.11 
 
 
459 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  39.33 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  37.99 
 
 
481 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  36.55 
 
 
463 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  35.75 
 
 
469 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  37.44 
 
 
509 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.09 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  35 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  36.51 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.76 
 
 
476 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  36.47 
 
 
456 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  36.24 
 
 
461 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  36.87 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  34.68 
 
 
514 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  36.45 
 
 
461 aa  250  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  36.51 
 
 
464 aa  249  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.28 
 
 
464 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  35.14 
 
 
448 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  35.14 
 
 
448 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  37.03 
 
 
457 aa  247  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  34.7 
 
 
448 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  37.1 
 
 
459 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  34.18 
 
 
468 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  35.22 
 
 
477 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  35.08 
 
 
428 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  34.83 
 
 
463 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  36.78 
 
 
469 aa  236  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  36.12 
 
 
454 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  34.84 
 
 
459 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.53 
 
 
457 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 
460 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  36.36 
 
 
460 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 
460 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.89 
 
 
441 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  32.13 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  32.78 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  33.18 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.62 
 
 
876 aa  212  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  33.25 
 
 
467 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  31.18 
 
 
453 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.43 
 
 
439 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  30.9 
 
 
944 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
943 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.51 
 
 
443 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.29 
 
 
949 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.46 
 
 
442 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.29 
 
 
949 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.16 
 
 
461 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.77 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>