111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58946 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  100 
 
 		 419 aa  836    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  46.65 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  45.72 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  46.08 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  58.39 
 
 		 274 aa  327  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  35.61 
 
 		 474 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  28.81 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 		 529 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  28.09 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  25.85 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  26.18 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.32 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  26.3 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  24.48 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  21.72 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  24.41 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  20 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.95 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  23.95 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  23.95 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  22.51 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.79 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  21.19 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  23.79 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  21.92 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  21.03 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  21.97 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  20.57 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  26 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  19.84 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  23.78 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  22.09 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.61 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  19.35 
 
 		 388 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  19.11 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.09 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.09 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  21.5 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  21.5 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  21.5 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  23.08 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  21.5 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 437 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  21.25 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  22.51 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  19.95 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.48 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  21.04 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  20.69 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  20.76 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  22.71 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  24.09 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  20.38 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  21.84 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  21.45 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>