275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58642 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  100 
 
 		 541 aa  1116    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  33.33 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  29.34 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  26.2 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.9 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  30.64 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  29.61 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  29.79 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  31.33 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  28.24 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  27.8 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  27.27 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  22.29 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  27.47 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  31.51 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.18 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.44 
 
 		 323 aa  62  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  29.88 
 
 		 407 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  32.87 
 
 		 365 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  31.82 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  25.53 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  30.43 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  31.33 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  28.57 
 
 		 243 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  29.79 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  40.26 
 
 		 217 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  29.55 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  29.8 
 
 		 325 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  31.87 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  31.16 
 
 		 250 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  31.25 
 
 		 345 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  34.18 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  26.64 
 
 		 235 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  32.54 
 
 		 348 aa  53.5  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  24.68 
 
 		 315 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.83 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  28.76 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  25.11 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  29.58 
 
 		 325 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  27.04 
 
 		 345 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  28.65 
 
 		 356 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  30.28 
 
 		 225 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  26.06 
 
 		 350 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  32.31 
 
 		 364 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  28.1 
 
 		 352 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  28.14 
 
 		 343 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  25.47 
 
 		 729 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  29.33 
 
 		 322 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  28.1 
 
 		 349 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  30.57 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  33.85 
 
 		 345 aa  50.4  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  31.69 
 
 		 347 aa  50.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  31.54 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  29.56 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  31.75 
 
 		 343 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  30.05 
 
 		 347 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  29.56 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  30.72 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  29.56 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  24.88 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  30.95 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  24.45 
 
 		 227 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  30.13 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  26.09 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  26.95 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  26.95 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  30.95 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  26.95 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  24.15 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  29.11 
 
 		 342 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  24.74 
 
 		 360 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  28.57 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  25.22 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  30.95 
 
 		 344 aa  48.9  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  32.24 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  26.22 
 
 		 347 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  31.58 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  32.24 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  28.11 
 
 		 350 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  28.95 
 
 		 358 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  30.82 
 
 		 355 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  30.88 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  26.35 
 
 		 345 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  33.33 
 
 		 359 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  25.13 
 
 		 351 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  26.22 
 
 		 227 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  29.61 
 
 		 343 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  30 
 
 		 349 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  30.99 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  31.29 
 
 		 352 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  28.48 
 
 		 359 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  29.49 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  28.85 
 
 		 344 aa  47.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  29.61 
 
 		 343 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  30 
 
 		 349 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  26.97 
 
 		 348 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  30.26 
 
 		 353 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  30.26 
 
 		 353 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>