More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16725 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  100 
 
 		 115 aa  237  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  39.82 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  39.13 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  37.17 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  35.71 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 171 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  30 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  25.66 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  25.66 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  24.78 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  30.36 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  24.78 
 
 		 242 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  26.13 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  35.09 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  33.63 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.41 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.41 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  26.36 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  30 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  30.97 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>