More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1771 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  75.36 
 
 		 138 aa  225  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  52.54 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  43.7 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  43.7 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  42.96 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  41.79 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 214 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 175 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  43.86 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 175 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 231 aa  84.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 188 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 220 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 184 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 242 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  42.61 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.12 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.59 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.59 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.66 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  33.88 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  38.05 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.12 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  36.52 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  40.37 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02665  single-strand DNA-binding protein  36.94 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>