More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4370 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  55.75 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 192 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 225 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 220 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  43.36 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 242 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  40 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.11 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 230 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  43.52 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.74 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.74 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 222 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  41.12 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  35.19 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  40.19 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 238 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  40.82 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  36.73 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  35.19 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  35.19 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>