235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13095 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  100 
 
 
97 aa  202  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  61.18 
 
 
210 aa  120  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  57.47 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  55.29 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  51.72 
 
 
217 aa  97.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  51.19 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  40.7 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.56 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.78 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
98 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
98 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  35.44 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  34.09 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
94 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  30.95 
 
 
441 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  34.04 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.74 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  35.14 
 
 
497 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.72 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  34.04 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  41.27 
 
 
552 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  29.67 
 
 
90 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  32.14 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  32.32 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30.77 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  31.51 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  32.32 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.77 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  29.03 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  30.67 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 
85 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  38.89 
 
 
838 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
101 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  33.33 
 
 
439 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  27.5 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  35 
 
 
373 aa  50.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  31.03 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  31.58 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
319 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  30.56 
 
 
182 aa  50.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  32 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  30.14 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>