More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1048 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  63.14 
 
 
564 aa  669    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  64.47 
 
 
603 aa  815    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  100 
 
 
623 aa  1291    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  66.29 
 
 
611 aa  861    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  66.29 
 
 
611 aa  861    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
604 aa  542  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  46.39 
 
 
601 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  44.8 
 
 
590 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  44.8 
 
 
590 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
604 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  44.64 
 
 
590 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
586 aa  523  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  43.93 
 
 
590 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
600 aa  512  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  41.8 
 
 
609 aa  512  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  43.2 
 
 
592 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  44.28 
 
 
589 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  42.11 
 
 
606 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  42.22 
 
 
600 aa  499  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  41.09 
 
 
595 aa  500  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  42.19 
 
 
589 aa  498  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  44.21 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  41.3 
 
 
610 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  42.54 
 
 
588 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  42.15 
 
 
589 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  42.28 
 
 
600 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  41.87 
 
 
590 aa  488  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  43.36 
 
 
604 aa  484  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  40.45 
 
 
590 aa  464  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  40.61 
 
 
590 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  41 
 
 
584 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  40.38 
 
 
589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  39.46 
 
 
590 aa  451  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.2 
 
 
473 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  25.79 
 
 
672 aa  96.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  23.55 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  23.09 
 
 
656 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  24.41 
 
 
575 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  27.08 
 
 
573 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.87 
 
 
489 aa  95.1  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  25.9 
 
 
534 aa  94.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  24.71 
 
 
636 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.39 
 
 
537 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  25.79 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  24.71 
 
 
651 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  25.62 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  24.86 
 
 
537 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  24.35 
 
 
495 aa  92  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  25.33 
 
 
636 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  26.17 
 
 
624 aa  91.3  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  24.86 
 
 
636 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  24.95 
 
 
636 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  26.1 
 
 
633 aa  91.3  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  24.48 
 
 
539 aa  90.9  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  26.21 
 
 
543 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  27.37 
 
 
501 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
502 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.22 
 
 
635 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  24.37 
 
 
909 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  26.1 
 
 
543 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.42 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.42 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.42 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  23.76 
 
 
450 aa  88.6  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.42 
 
 
635 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.1 
 
 
489 aa  87  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  23.69 
 
 
474 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.09 
 
 
587 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  25.69 
 
 
543 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.37 
 
 
564 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.29 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  23.68 
 
 
879 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  32.99 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  25.56 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  24.36 
 
 
643 aa  83.6  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  23.05 
 
 
510 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  25.61 
 
 
481 aa  83.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 
543 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  26.52 
 
 
541 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  34.34 
 
 
255 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  33.66 
 
 
353 aa  83.2  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.93 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  33.87 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.55 
 
 
564 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  25.25 
 
 
638 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  34.05 
 
 
369 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3229  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 
369 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  30.21 
 
 
268 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  25.83 
 
 
557 aa  82  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  33.85 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  32.99 
 
 
397 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  24.81 
 
 
638 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  25.38 
 
 
556 aa  82  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  31.32 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.18 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  23.11 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>