More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0435 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
604 aa  646    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  71.04 
 
 
589 aa  882    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  56.83 
 
 
588 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  71.09 
 
 
590 aa  902    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  100 
 
 
588 aa  1203    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  57.8 
 
 
589 aa  677    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  53.16 
 
 
609 aa  635    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
604 aa  636    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  69.56 
 
 
589 aa  868    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  56.75 
 
 
584 aa  664    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  53.76 
 
 
606 aa  639    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  67.58 
 
 
600 aa  845    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  53.32 
 
 
610 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  50.59 
 
 
590 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  50.42 
 
 
590 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  49.41 
 
 
590 aa  585  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  49.83 
 
 
592 aa  588  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
586 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  50.08 
 
 
590 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.25 
 
 
601 aa  544  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  43.24 
 
 
595 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  47.88 
 
 
590 aa  538  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  47.04 
 
 
590 aa  536  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  46.96 
 
 
589 aa  528  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  46.53 
 
 
590 aa  523  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.14 
 
 
603 aa  502  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  45.21 
 
 
604 aa  504  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  43 
 
 
600 aa  500  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.54 
 
 
623 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  42.18 
 
 
611 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  42.18 
 
 
611 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  42.33 
 
 
600 aa  492  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  42.97 
 
 
564 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.73 
 
 
646 aa  127  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  24.91 
 
 
644 aa  126  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  25.83 
 
 
643 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 
645 aa  114  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.52 
 
 
644 aa  112  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  25.67 
 
 
649 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  27.41 
 
 
449 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  25.24 
 
 
643 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.95 
 
 
670 aa  107  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  28.32 
 
 
632 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26.14 
 
 
493 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  24.27 
 
 
668 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.46 
 
 
553 aa  104  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 
553 aa  103  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  25.2 
 
 
622 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  24.91 
 
 
620 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1268  ABC transporter-related protein  24.57 
 
 
646 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
554 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.86 
 
 
556 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  26.93 
 
 
631 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  25.34 
 
 
633 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.78 
 
 
560 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.34 
 
 
554 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  23.29 
 
 
639 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 
635 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  25.72 
 
 
634 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  24.83 
 
 
635 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  25.65 
 
 
624 aa  102  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.34 
 
 
554 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  26.34 
 
 
636 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  26.34 
 
 
636 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  25.78 
 
 
640 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.09 
 
 
705 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 
635 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  25.25 
 
 
636 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  28.3 
 
 
709 aa  100  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  26.63 
 
 
653 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.28 
 
 
555 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  24.05 
 
 
634 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  25.25 
 
 
651 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  26.14 
 
 
615 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.43 
 
 
639 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  25.65 
 
 
647 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 
557 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.24 
 
 
559 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  26.34 
 
 
636 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.56 
 
 
640 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.91 
 
 
637 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  24.95 
 
 
644 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 
555 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.97 
 
 
595 aa  98.6  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
554 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.99 
 
 
600 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.14 
 
 
561 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 
557 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  24.43 
 
 
636 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.09 
 
 
555 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.09 
 
 
555 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  25.54 
 
 
628 aa  98.2  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  26 
 
 
636 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
557 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
557 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.72 
 
 
561 aa  97.8  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
557 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  23.96 
 
 
879 aa  97.4  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.37 
 
 
555 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  23.79 
 
 
555 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>