More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1854 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  60.13 
 
 
604 aa  729    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  57.14 
 
 
609 aa  711    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  74.83 
 
 
588 aa  916    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  59.46 
 
 
589 aa  731    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  60.64 
 
 
604 aa  744    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  57.8 
 
 
588 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  59.56 
 
 
590 aa  733    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  100 
 
 
589 aa  1208    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  57.19 
 
 
600 aa  693    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  59.77 
 
 
606 aa  728    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  61.42 
 
 
589 aa  729    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  63.01 
 
 
584 aa  743    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  59.8 
 
 
610 aa  740    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  54.42 
 
 
590 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  54.42 
 
 
590 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  52.21 
 
 
586 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  53.91 
 
 
590 aa  623  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  52.63 
 
 
592 aa  610  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  51.43 
 
 
590 aa  609  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  45.79 
 
 
595 aa  550  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  48.49 
 
 
601 aa  551  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
600 aa  543  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  45.53 
 
 
611 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  45.53 
 
 
611 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  46.14 
 
 
604 aa  529  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  45.45 
 
 
600 aa  527  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  44.86 
 
 
590 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  44.28 
 
 
623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  44.01 
 
 
590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  44.31 
 
 
603 aa  512  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  43.49 
 
 
589 aa  501  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  42.93 
 
 
590 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  43.49 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.88 
 
 
489 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 
631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 
631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  24.85 
 
 
630 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.44 
 
 
554 aa  113  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 
631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  24.03 
 
 
636 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  25.45 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  25.69 
 
 
620 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.1 
 
 
579 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  24.75 
 
 
631 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  24.51 
 
 
643 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  27.5 
 
 
531 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25.51 
 
 
593 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26.17 
 
 
493 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  26.42 
 
 
920 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.85 
 
 
518 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  24.55 
 
 
631 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  24.75 
 
 
631 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.54 
 
 
543 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  23.68 
 
 
629 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  26.19 
 
 
493 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  25.45 
 
 
542 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  24.05 
 
 
643 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  26.71 
 
 
690 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  26.86 
 
 
631 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.95 
 
 
500 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  25.1 
 
 
630 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  24.35 
 
 
631 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  25.69 
 
 
638 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  25.79 
 
 
653 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  25 
 
 
559 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  22.97 
 
 
639 aa  105  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  23.62 
 
 
644 aa  105  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  25.98 
 
 
543 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  27.59 
 
 
478 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.1 
 
 
559 aa  104  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  26.21 
 
 
636 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  27.14 
 
 
543 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  25.59 
 
 
545 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  26.02 
 
 
651 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 
770 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.61 
 
 
560 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  23.96 
 
 
925 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  27.3 
 
 
543 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  27.3 
 
 
543 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  27.3 
 
 
543 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.61 
 
 
560 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  24.81 
 
 
564 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 
559 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.31 
 
 
561 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  25.73 
 
 
543 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  26.51 
 
 
547 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  25.34 
 
 
540 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  26.94 
 
 
535 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  26.46 
 
 
543 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  24.91 
 
 
635 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.66 
 
 
549 aa  100  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  23.99 
 
 
647 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  24.14 
 
 
632 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.15 
 
 
634 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  22.45 
 
 
645 aa  100  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  25.84 
 
 
526 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  25.44 
 
 
649 aa  100  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>