More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1332 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  100 
 
 
590 aa  1204    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  58.64 
 
 
588 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  56.76 
 
 
606 aa  684    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  56.95 
 
 
604 aa  694    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  71.09 
 
 
588 aa  890    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  54.98 
 
 
610 aa  670    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  59.56 
 
 
589 aa  713    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  59.49 
 
 
584 aa  694    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  75.38 
 
 
589 aa  935    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  54.98 
 
 
609 aa  675    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
604 aa  675    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  68.76 
 
 
600 aa  865    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  73.8 
 
 
589 aa  921    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  52.38 
 
 
592 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  51.96 
 
 
590 aa  611  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  51.62 
 
 
590 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  51.96 
 
 
590 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  51.45 
 
 
590 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  48.3 
 
 
586 aa  595  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  45.59 
 
 
595 aa  560  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.42 
 
 
601 aa  555  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  46.36 
 
 
590 aa  533  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  47.8 
 
 
589 aa  534  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
600 aa  524  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  46.19 
 
 
590 aa  524  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  46.02 
 
 
590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  45.09 
 
 
604 aa  514  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  42.5 
 
 
600 aa  499  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.05 
 
 
603 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  42.23 
 
 
611 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  42.23 
 
 
611 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  41.87 
 
 
623 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  41.07 
 
 
564 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 
643 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  24.95 
 
 
644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  26.06 
 
 
464 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  29.4 
 
 
535 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 
553 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  27.24 
 
 
632 aa  107  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  26.52 
 
 
535 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  25.29 
 
 
643 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0269  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
561 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.9 
 
 
490 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.02 
 
 
493 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3690  ABC transporter, ATPase subunit  25.67 
 
 
599 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  26.37 
 
 
494 aa  105  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.37 
 
 
634 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.69 
 
 
555 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  25.88 
 
 
540 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.29 
 
 
600 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.19 
 
 
495 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.92 
 
 
595 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  28.37 
 
 
532 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.53 
 
 
554 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  35.26 
 
 
577 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  26.15 
 
 
539 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.08 
 
 
553 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46540  ABC(ATP-binding) family transporter (Uup-like protein/duplicated ATPase)  26.81 
 
 
549 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953997  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.38 
 
 
554 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.38 
 
 
554 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  25.5 
 
 
518 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  24.9 
 
 
879 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  27.49 
 
 
547 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  25.56 
 
 
628 aa  100  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  25.56 
 
 
628 aa  100  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 
518 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 
560 aa  100  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
481 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  27.75 
 
 
566 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.74 
 
 
559 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.44 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  24.31 
 
 
623 aa  99  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  29.74 
 
 
258 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 
551 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.27 
 
 
556 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  25.68 
 
 
568 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 
525 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.56 
 
 
561 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  24.5 
 
 
530 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  26.27 
 
 
559 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  26.92 
 
 
502 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
559 aa  98.2  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  24.75 
 
 
638 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  31.46 
 
 
293 aa  98.2  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
264 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 
298 aa  97.8  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1379  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.84 
 
 
554 aa  97.4  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.621698  hitchhiker  0.000163615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  30.81 
 
 
262 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  25.1 
 
 
547 aa  97.4  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  25.15 
 
 
636 aa  97.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  27.94 
 
 
571 aa  97.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  24.16 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  31.32 
 
 
261 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  26.92 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  25.5 
 
 
632 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  24.25 
 
 
568 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  22.35 
 
 
620 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  25.57 
 
 
540 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  22.58 
 
 
555 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>